Jälkiruoan viiniksi valitaan pääsääntöisesti viini, joka on jälkiruokaa makeampi. Joidenkin jälkiruokien seuraan sopii myös kuiva samppanja.
Jälkiruokaviineinä käytetään erilaisia makeita valkoviinejä, mutta täyteläisille, esimerkiksi suklaasta valmistetuille jälkiruoille sopivat myös monet väkevät viinit, kuten portviini.